Er is een betekenisverschil.

 

goddeloos

onheilig, oneerbiedig
Geboortebeperking is volgens sommigen een goddeloos verzinsel.

 

godloos

atheïstisch, een wereld zonder God
Hij hangt een godloos geloof aan.

 

Voor meer woordparen waarbij een e tot een betekenisverschil kan leiden, kijkt u bij bandeloos / bandloos.