Er is een betekenisverschil.
zei
verleden tijd van zeggen
Zei zij nu dat de winkel al dicht was?
zij
persoonlijk voornaamwoord enkelvoud vrouwelijk en meervoud; aanvoegende wijs van zijn
Het zij zo, zei zij.
De variatie ei-ij kent meer woordparen. Voor andere struikelblokken kijkt u bij bereiden / berijden.